What is it that he wants? 이 문장의 is it that 부분에 대해서 이해를 못하는 학생들이 많은데요. 다음과 같은 과정에 의해서 생겼다고 보시면 되겠습니다.

평서문이 있고요

a. He wants the laptop computer.

이것을 it is -- that 강조구문으로 고치면

b. It is the laptop computer that he wants.

그리고 강조구문을 의문문으로 고치면

c. Is it the laptop computer that he wants?

이 문장을 what을 이용한 의문문으로 고치면 다음과 같습니다.

d. What is it that he wants?

간접의문문으로 고치면

I don't know what it is that he want.

또 다른 예를 보면
You need to be able to devise a blueprint that communicates to your musicians what it is you want to hear.                (2009년 고3 6월 평가원모의고사 34번)

you want to hear what.
it is what that you want to hear.
What is it that you want to hear

간접의문문으로 고치면
....What it is (that) you want to hear.